Мир дикой природы на wwlife.ru
Вы находитесь здесь:Новости>>Новости Генетики>>Выявлен новый уровень структурирования ДНК

Вторник, 22 Март 2011 00:00

Выявлен новый уровень структурирования ДНК

Автор 

Испанские учёные из Университета Гранады и Университета Малаги выявили наиболее крупную структурную единицу генома человека.

Хромосомы человека под сканирующим электронным микроскопом  (иллюстрация Biophoto Associates / Science Photo Library) Хромосомы человека под сканирующим электронным микроскопом (иллюстрация Biophoto Associates / Science Photo Library) Ранее самыми большими элементами структуры ДНК считались изохоры — сегменты, длина которых доходит до сотен тысяч пар оснований. Изохоры отличаются друг от друга по содержанию азотистых оснований гуанина (Г) и цитозина (Ц). Каждому семейству изохор соответствует своё ГЦ-содержание, которое поддерживается на одном уровне во всём сегменте.

Искать более крупные структурные единицы авторам помогал вполне обычный алгоритм, основанный на понятии энтропии. Термодинамическая энтропия, как известно, связана со статистическим весом состояния — числом способов, которыми можно перейти в это состояние. Если при подбрасывании монеты, к примеру, пять раз подряд выпадали решки, а потом выпала аналогичная последовательность орлов, то весь ряд имеет высокую «энтропию», так как получить в десяти опытах равное количество орлов и решек можно самыми разными способами. Последовательности из пяти одинаковых результатов имеют прямо противоположные свойства.

В процессе поиска нуклеотидный ряд разбивался на сегменты так, чтобы энтропийная разность между отдельными отрезками и всей последовательностью оказалась максимальной. Полученные результаты сравнивались с теми, которые дало бы случайное расположение нуклеотидов в геноме. Заметим, что здесь исследователи учитывали важную особенность реальной ДНК: вероятность появления в ней конкретного азотистого основания зависит от предшествующих нуклеотидов. Обычно при сравнении использовали простую случайную последовательность оснований.

Как выяснилось, каждая хромосома составлена из нескольких огромных (~107 пар оснований) сегментов со сравнительно стабильным ГЦ-содержанием. Эти сегменты содержат в среднем по 200 генов.

Если открытые «суперструктуры» реальны, они должны иметь некий биологический смысл. Учёные показали, что это условие выполняется, задействовав базу данных, в которой каждому гену присваивается набор терминов, описывающих его функции. У любых двух генов из одной «суперструктуры» совпадают около 18 терминов, тогда как гены, выбранные случайным образом, схожи лишь по шести характеристикам.

Полная версия отчёта опубликована в журнале Physical Review E


Источник: КОМПЬЮЛЕНТА


Прочитано 8342 раз

Авторизуйтесь, чтобы получить возможность оставлять комментарии

Случайные статьи

  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
Предыдущая Следующая

Летать могли только ярко раскрашенные динозавры

19-02-2014 Просмотров:5295 Новости Палеонтологии Антоненко Андрей - avatar Антоненко Андрей

Летать могли только ярко раскрашенные динозавры

Содержащие меланин клеточные органеллы пушистых динозавров, таких как T. rex или синозавроптерикс, похожи на таковые других амниотов — ящериц и крокодилов, то есть разнообразие форм меланосом ограничено и не позволяет...

В юрских сланцах нашли современную личинку краба

16-03-2015 Просмотров:4514 Новости Палеонтологии Антоненко Андрей - avatar Антоненко Андрей

В юрских сланцах нашли современную личинку краба

Международная группа ученых опубликовала результаты исследования окаменевшей личинки краба, датирующейся возрастом в 150 млн лет. По собственному признанию палеонтологов, больше всего их потрясло удивительно современное строение этого организма. Сравенение личинок Чтобы поймать...

Зачем пираньям голос

15-10-2011 Просмотров:10567 Новости Зоологии Антоненко Андрей - avatar Антоненко Андрей

Зачем пираньям голос

Обыкновенные пираньи не лезут в драку без нужды — а чтобы уладить конфликт без кровопролития, они используют звуковые сигналы. Пиранья обыкновенная (фото King Kong 911)Ужасные, кровожадные пираньи в столкновениях друг с...

90 млн лет назад в Арктике стояла 35-градусная жара

21-12-2016 Просмотров:3639 Новости Палеонтологии Антоненко Андрей - avatar Антоненко Андрей

90 млн лет назад в Арктике стояла 35-градусная жара

Палеонтологи обнаружили в Арктике крупную птицу, присутствие которой свидетельствует об аномальной жаре, установившейся в регионе во второй половине мелового периода. Tingmiatornis arcticaОб этом говорится в статье американских специалистов из Рочестерского университета,...

Чир - Coregonus nasus

16-11-2012 Просмотров:13230 Рыбы Енисея Антоненко Андрей - avatar Антоненко Андрей

Чир - Coregonus nasus

Чир - один из распространенных видов рыб в системе Енисея. Обитает главным образом за Полярным кругом, в реках и озерах Игарского, Дудинского и Усть-Енисейского районов. Единично встречается до Ангары. Обычен...

top-iconВверх

© 2009-2018 Мир дикой природы на wwlife.ru. При использование материала, рабочая ссылка на него обязательна.