Мир дикой природы на wwlife.ru
Вы находитесь здесь:Новости>>Новости Генетики>>Выявлен новый уровень структурирования ДНК

Вторник, 22 Март 2011 00:00

Выявлен новый уровень структурирования ДНК

Автор 

Испанские учёные из Университета Гранады и Университета Малаги выявили наиболее крупную структурную единицу генома человека.

Хромосомы человека под сканирующим электронным микроскопом  (иллюстрация Biophoto Associates / Science Photo Library) Хромосомы человека под сканирующим электронным микроскопом (иллюстрация Biophoto Associates / Science Photo Library) Ранее самыми большими элементами структуры ДНК считались изохоры — сегменты, длина которых доходит до сотен тысяч пар оснований. Изохоры отличаются друг от друга по содержанию азотистых оснований гуанина (Г) и цитозина (Ц). Каждому семейству изохор соответствует своё ГЦ-содержание, которое поддерживается на одном уровне во всём сегменте.

Искать более крупные структурные единицы авторам помогал вполне обычный алгоритм, основанный на понятии энтропии. Термодинамическая энтропия, как известно, связана со статистическим весом состояния — числом способов, которыми можно перейти в это состояние. Если при подбрасывании монеты, к примеру, пять раз подряд выпадали решки, а потом выпала аналогичная последовательность орлов, то весь ряд имеет высокую «энтропию», так как получить в десяти опытах равное количество орлов и решек можно самыми разными способами. Последовательности из пяти одинаковых результатов имеют прямо противоположные свойства.

В процессе поиска нуклеотидный ряд разбивался на сегменты так, чтобы энтропийная разность между отдельными отрезками и всей последовательностью оказалась максимальной. Полученные результаты сравнивались с теми, которые дало бы случайное расположение нуклеотидов в геноме. Заметим, что здесь исследователи учитывали важную особенность реальной ДНК: вероятность появления в ней конкретного азотистого основания зависит от предшествующих нуклеотидов. Обычно при сравнении использовали простую случайную последовательность оснований.

Как выяснилось, каждая хромосома составлена из нескольких огромных (~107 пар оснований) сегментов со сравнительно стабильным ГЦ-содержанием. Эти сегменты содержат в среднем по 200 генов.

Если открытые «суперструктуры» реальны, они должны иметь некий биологический смысл. Учёные показали, что это условие выполняется, задействовав базу данных, в которой каждому гену присваивается набор терминов, описывающих его функции. У любых двух генов из одной «суперструктуры» совпадают около 18 терминов, тогда как гены, выбранные случайным образом, схожи лишь по шести характеристикам.

Полная версия отчёта опубликована в журнале Physical Review E


Источник: КОМПЬЮЛЕНТА


Прочитано 8898 раз

Авторизуйтесь, чтобы получить возможность оставлять комментарии

Случайные статьи

  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
Предыдущая Следующая

Африканское растение раскрашивает свои ягоды целлюлозой

11-09-2012 Просмотров:7614 Новости Ботаники Антоненко Андрей - avatar Антоненко Андрей

Африканское растение раскрашивает свои ягоды целлюлозой

Ягоды африканского растения Pollia condensata приобретают яркую переливающуюся расцветку благодаря оптическому эффекту, создаваемому слоями целлюлозы в стенках клеток. Ягоды P. condensata (здесь и ниже фото авторов исследования)Pollia condensata привлекает птиц переливающимся...

Японские раки съели... остров

21-01-2011 Просмотров:9589 Новости Зоологии Антоненко Андрей - avatar Антоненко Андрей

Японские раки съели... остров

Людям, живущим на островах, угрожают не только тайфуны, цунами и извержения вулканов. Обитатели моря также могут разрушить их родные места. Так, например, недавно у берегов Японии микроскопические раки буквально съели...

Рогатый архозавроморф предвосхитил появление цератопсов

23-08-2017 Просмотров:1700 Новости Палеонтологии Антоненко Андрей - avatar Антоненко Андрей

Рогатый архозавроморф предвосхитил появление цератопсов

Пермотриасовое вымирание, положившее конец господству наших родственников синапсид, расчистило дорогу динозаврам. Но сначала, в триасе, пришла очередь архозавроморфов – причудливых рептилий, во многом предвосхитивших эволюционные находки динозавров, до появления которых...

Существуют ли мегалодоны?

14-08-2013 Просмотров:8574 Новости Палеонтологии Антоненко Андрей - avatar Антоненко Андрей

Существуют ли мегалодоны?

Британский палеонтолог Даррен Нейш в компании с художниками Си-Эм Коузменом и Джоном Конвеем занят чрезвычайно интересным делом: он пишет своего рода энциклопедию криптозоологии Cryptozoologicon, а кусочки из неё публикует в...

В Китае обнаружены «белки» юрского периода

11-09-2014 Просмотров:5573 Новости Палеонтологии Антоненко Андрей - avatar Антоненко Андрей

В Китае обнаружены «белки» юрского периода

Ученые откопали в Китае сразу шесть скелетов млекопитающих, которые существовали в середине юрского периода. Открытие заставляет пересмотреть взгляды на эволюцию этого класса живых организмов. В Китае обнаружены «белки» юрского периодаОписание находки,...

top-iconВверх

© 2009-2019 Мир дикой природы на wwlife.ru. При использование материала, рабочая ссылка на него обязательна.