Мир дикой природы на wwlife.ru
Вы находитесь здесь:Новости>>Новости Генетики>>Выявлен новый уровень структурирования ДНК

Вторник, 22 Март 2011 00:00

Выявлен новый уровень структурирования ДНК

Автор 

Испанские учёные из Университета Гранады и Университета Малаги выявили наиболее крупную структурную единицу генома человека.

Хромосомы человека под сканирующим электронным микроскопом  (иллюстрация Biophoto Associates / Science Photo Library) Хромосомы человека под сканирующим электронным микроскопом (иллюстрация Biophoto Associates / Science Photo Library) Ранее самыми большими элементами структуры ДНК считались изохоры — сегменты, длина которых доходит до сотен тысяч пар оснований. Изохоры отличаются друг от друга по содержанию азотистых оснований гуанина (Г) и цитозина (Ц). Каждому семейству изохор соответствует своё ГЦ-содержание, которое поддерживается на одном уровне во всём сегменте.

Искать более крупные структурные единицы авторам помогал вполне обычный алгоритм, основанный на понятии энтропии. Термодинамическая энтропия, как известно, связана со статистическим весом состояния — числом способов, которыми можно перейти в это состояние. Если при подбрасывании монеты, к примеру, пять раз подряд выпадали решки, а потом выпала аналогичная последовательность орлов, то весь ряд имеет высокую «энтропию», так как получить в десяти опытах равное количество орлов и решек можно самыми разными способами. Последовательности из пяти одинаковых результатов имеют прямо противоположные свойства.

В процессе поиска нуклеотидный ряд разбивался на сегменты так, чтобы энтропийная разность между отдельными отрезками и всей последовательностью оказалась максимальной. Полученные результаты сравнивались с теми, которые дало бы случайное расположение нуклеотидов в геноме. Заметим, что здесь исследователи учитывали важную особенность реальной ДНК: вероятность появления в ней конкретного азотистого основания зависит от предшествующих нуклеотидов. Обычно при сравнении использовали простую случайную последовательность оснований.

Как выяснилось, каждая хромосома составлена из нескольких огромных (~107 пар оснований) сегментов со сравнительно стабильным ГЦ-содержанием. Эти сегменты содержат в среднем по 200 генов.

Если открытые «суперструктуры» реальны, они должны иметь некий биологический смысл. Учёные показали, что это условие выполняется, задействовав базу данных, в которой каждому гену присваивается набор терминов, описывающих его функции. У любых двух генов из одной «суперструктуры» совпадают около 18 терминов, тогда как гены, выбранные случайным образом, схожи лишь по шести характеристикам.

Полная версия отчёта опубликована в журнале Physical Review E


Источник: КОМПЬЮЛЕНТА


Прочитано 9353 раз

Авторизуйтесь, чтобы получить возможность оставлять комментарии

Случайные статьи

  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
Предыдущая Следующая

У муравьёв обнаружено разделение по зрению

10-10-2010 Просмотров:11125 Новости Зоологии Антоненко Андрей - avatar Антоненко Андрей

У муравьёв обнаружено разделение по зрению

Энтомологи Австралийского национального университета установили, что у муравьёв-бульдогов (bull ant) с Зелёного континента зрение эволюционировало согласно делению по обязанностям. Исследователи выяснили, что внутри одного вида муравьёв деление на роли в колонии...

Найдены древнейшие млекопитающие юрского периода

14-08-2013 Просмотров:8128 Новости Палеонтологии Антоненко Андрей - avatar Антоненко Андрей

Найдены древнейшие млекопитающие юрского периода

Палеонтологи ломают голову над тем, в каком месте генеалогического древа млекопитающих следует разместить два новых чрезвычайно загадочных вида. Специалисты, которые провели анализ одного из ископаемых, пришли к выводу, что перед...

Развитие головы у животных началось с безголовых актиний

21-02-2013 Просмотров:9662 Новости Эволюции Антоненко Андрей - avatar Антоненко Андрей

Развитие головы у животных началось с безголовых актиний

Исследователи из Венского университета (Австрия) вместе с норвежскими коллегами из Бергенского университета обнаружили, что голова у животных начала развиваться ещё до своего появления. Речь идёт, разумеется, о генетическом аппарате, который...

В Аргентине нашли «саблезубую белку»

06-11-2011 Просмотров:8797 Новости Палеонтологии Антоненко Андрей - avatar Антоненко Андрей

В Аргентине нашли «саблезубую белку»

В Аргентине обнаружены останки странного млекопитающего, жившего 95 млн лет назад. Оно вполне могло бы оказаться прототипом саблезубой белки из мультфильмов о ледниковом периоде. О мезозойских млекопитающих, существовавших в тени динозавров,...

Скорость реакции нервной цепи не зависит от её размеров

04-02-2014 Просмотров:6058 Новости Нейробиологии Антоненко Андрей - avatar Антоненко Андрей

Скорость реакции нервной цепи не зависит от её размеров

Работу нервной цепи обычно описывают скоростью реакции: это один из краеугольных параметров любой «науки о мозге», будь то психология или нейробиология. С помощью скорости реакции удалось построить весьма эффективные модели,...

top-iconВверх

© 2009-2020 Мир дикой природы на wwlife.ru. При использование материала, рабочая ссылка на него обязательна.