Биологи создали самое всеобъемлющее родословное древо живых организмов. В него вошли данные о двух с лишним миллионах биологических видов.

Филогенетическое деревоЗа последние годы ученые опубликовали тысячи филогенетических деревьев, которые построены на основе молекулярных и морфологических данных и показывают степень родства различных таксонов. Авторы статьи решили свести все эти деревья, относящиеся к различным группам живых организмов, в единое «супердерево» жизни.

Над созданием «супердерева» жизни трудились специалисты из 11 американских научных организаций. С ним можно ознакомиться на сайте проекта. Статья с описанием «супердерева» будет опубликована в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences.

Всего глобальная родословная жизни содержит сведения о родственных связях 2,3 миллионов таксономических единиц - как видов в традиционном смысле слова, так и штаммов бактерий и вирусов. Первоначальная версия «супердерева» включала в себя около 500 менее крупных филогенетических деревьев.

Всего же исследователи просмотрели более 7500 публикаций в 100 журналах за 2000-2012 годы, посвященные реконструкции родственных отношений различных организмов. Оказалось, что только в 6 случаях их авторы размещали свои данные не в виде картинок и файлов PDF, а в виде цифровых архивов, с которыми удобно работать.

Разработчики «супердерева» столкнулись и с другими трудностями - например, один и тот же вид нередко фигурирует в разных исследованиях под разными именами. Поэтому работа по совершенствованию глобальной генеалогии всего живого продолжится. «Это была первая реальная попытка соединить воедино все точки, считайте наше дерево версией 1.0», -- пояснила Кпрен Крэнстон, соавтор статьи.

Источник: infox.ru

Последний всеобщий предок (также переводится как «Последний универсальный предок») (англ. last universal ancestor, LUA), иначе Последний универсальный общий предок (англ. last universal common ancestor, LUCA) — ближайший общий предок всех ныне живущих на Земле живых организмов. Последний общий предок жил совместно с другими различными обитателями архея предположительно 3,6—3,8 млрд лет назад в эоархейскую эру. Это были уже довольно сложно эволюционированные организмы, его появлению предшествовала долгая эволюция (первая жизнь на нашей планете зародилась более 4 млрд. лет назад во времена катаархея). Предполагается, что все современники последнего всеобщего предка вымерли и до сегодняшнего дня дошло только его генетическое наследство. Или, как было предложено Карлом Вёзе, возможно, никакой из отдельных организмов не может рассматриваться в качестве последнего всеобщего предка, но генетическое наследие всех современных организмов произошло посредством горизонтального переноса генов среди древнего сообщества организмов

Рис. 1. Филогенетическое дерево живых организмов на основе РНК данных и теории Карла Вёзе (википедия)В конце 1970-х годов когда Карл Вёзе предложил трехдоменную классификацию организмов (рис. 1). Полагая, что представители первой из выделенных им групп прокариот могут быть более древними, чем собственно бактерии, Вёзе назвал их архебактериями, или археями. Это утверждение было подкреплено тем, что все известные археи обладали крайне высокой устойчивостью к экстремальным состояниям окружающей среды, таким как высокая солёность, температура и кислотность, и привело некоторых учёных к предположению, что последний всеобщий предок развивался в таких местах, как чёрные курильщики, где такие крайности господствуют поныне. Однако впоследствии он пришёл к выводу о том, что обе группы произошли от общего предка и предложил термин «прогенот» для обозначения примитивной предковой формы. Кроме того, были открыты археи, существующие в менее враждебных средах, на основе чего был сделан вывод, что последний всеобщий предок предпочитал температуры, не превосходящие 50 °C. Теперь многие систематики полагают, что они более тесно связаны с эукариотами и бактериями, хотя это остаётся спорным вопросом.

 Черты присущие последнему общему предку

Трехдоменное филогенетическое дерево жизни. Эукариоты красного, археи - зеленого и бактерии синего цветов (википедия)Черты присущие последнему всеобщему предку сформулированы на основе черт, свойственных всем независимо существующим организмам на Земле.

• Рис. 3. Филогенетическое дерево жизни по трехдоменной системе, показывающее связь между видами, чьи геномы были упорядоченные до 2006г. В самом центре Последний общий предок. Розовый цвет - эукариоты, зеленый - археи и синий - бактерии (википедия)Генетическая информация основана на ДНК.
  1. ДНК состоит из четырёх нуклеотидов (аденин, гуанин, тимин, цитозин).
  2. Генетический код составляют состоящие из трёх нуклеотидов кодоны, образуя 64 различных триплета. Поскольку используется только 20 аминокислот, то разные кодоны кодируют одни и те же аминокислоты. Такое соответствие случайно и существует как среди эукариотов, так и прокариотов. Археи и митохондрии используют похожее кодирование с небольшими отличиями.
  3. ДНК остаётся состоящей из двух нитей благодаря зависимости от шаблона ДНК-полимеразы.
  4. Целостность ДНК обеспечивается группой обслуживающих ферментов, включая топоизомеразу, ДНК-лигазу и другие ферменты репарации ДНК. Помимо этого ДНК защищена связывающими её белками, таким как гистоны.
• Генетическая информация отображается через промежуточные РНК, состоящие из одной нити.
  1. РНК производится зависимой от ДНК РНК-полимеразой с использованием нуклеотидов, сходных с нуклеотидами ДНК, за исключением тимидина ДНК, вместо которого в РНК служит уридин.
• Рис. 4. Филогенетическое дерево объединяющая 5 царств с горизонтальным переносом генов (википедия).Генетическая информация отображается в белки. Все другие свойства организма (такие как синтез липидов или углеводов) — результат работы белков-ферментов.
• Белки собираются из свободных аминокислот, путём трансляции мРНК с помощью рибосом, тРНК и группы родственных белков.
  1. Рибосомы составлены из двух субъединиц, большой и малой.
  2. Каждая субъединица рибосомы включает ядро рибосомных рибонуклеиновых кислот и окружена рибосомными белками.
  3. Молекулы РНК (рРНК и тРНК) играют важную роль в каталитическом действии рибосом.
• Используется только 20 аминокислот, это лишь малая часть от бесчисленного множества нетипичных аминокислот. Используются только L-изомеры.
  1. Аминокислоты должны синтезироваться из глюкозы группой особых ферментов. Направления синтеза являются произвольными и сохраняющимися.
• Возможно использование глюкозы как источника энергии и углерода. Для этого используются D-изомеры.
  1. Гликолиз идёт по пути произвольного расщепления.
• АТФ используется как переносчик энергии.
• Клетка окружена клеточной стенкой состоящей из двойного липидного слоя — грамотрицательного типа.
• Внутри клетки концентрация натрия ниже, а калия — выше, чем снаружи. Отклонение поддерживается особенным ионным насосом.
• Клетка размножается путём репродуцирования всего своего содержания, за чем следует деление клетки.