Бурая водоросль Aureococcus anophagefferens в последние годы буквально заполонила некоторые части Мирового океана. Ученые выяснили, кто помог ей мутировать и как.
Цветение океана – серьезная проблема последних десятилетий. При благоприятных условиях, когда, например, в воде оказывается большое количество питательных веществ, в ней начинают быстро размножаться водоросли. Их концентрации могут достигать огромных величин, а вода из-за этого окрашивается в красный, зеленый или бурый цвета. Некоторые виды водорослей, особенно красных или зеленых, токсичны для человека. Тогда в «цветущих» водоемах опасно даже купаться. Бурые приливы – явление для человека неопасное, но вызывает массовый мор рыбы. Это приводит к спаду рыболовства и, следовательно, огромным экономическим убыткам. Естественно, что всех волнует вопрос, почему происходит такое цветение воды, и какие особенности помогают тем или иным видам фитопланктона быстро размножаться.
Группе ученых из США, Канады и Австралии под руководством доктора Кристофера Гоблера (Christopher J. Gobler) из Университета штата Нью-Йорк в Стоуни-Брук удалось выяснить, почему водоросли Aureococcus anophagefferens столь успешно размножаются, вызывая приливы. Ответ на вопрос скрывается в определенном наборе генов.
По словам доктора Гоблера, эти водоросли активно размножаются весной в районе восточного побережья США и у берегов Южной Африки. До 1985 года такого явления в этих акваториях вообще не наблюдалось. Но теперь каждый год весной там происходят «бурые» приливы. Водоросль Aureococcus anophagefferens предпочитает мелководья, особенно мутные воды эстуариев крупных рек — места, где света и неорганических питательных веществ недостаточно, зато в избытке органика – углерод и азот.
«Деятельность человека привела к образованию там новой экологической ниши, где создаются особые условия в результате выброса со стоком рек большого количества органических веществ. Для большинства водорослей такие условия губительны. Но Aureococcus anophagefferens имеет особый набор генов, как показали наши исследования, который позволяет этому виду прекрасно себя чувствовать в такой среде», — говорит Гоблер.
Ученым удалось полностью расшифровать геном Aureococcus anophagefferens еще в 2007 году — в нем оказалось 56 миллионов пар оснований. Доктор Гоблер и его коллеги сравнили эти данные с составом генома других шести видов водорослей, также вызывающих цветение воды. «Существуют такие вещи, которые Aureococcus anophagefferens умеют делать, а другие водоросли — нет. И эти преимущества зашифрованы на генетическом уровне. Прежде всего, это адаптация к условиям плохой освещенности. Без света эти водоросли могут прекрасно себя чувствовать в течение долгого времени. Например, Aureococcus anophagefferens имеет 62 гена, ответственных за улавливание света в процессе фотосинтеза. А другие водоросли, тоже обитающие в заливе, но гораздо менее многочисленные, содержат примерно в два раза меньше этих генов», — говорит Гоблер. Еще одна удивительная закрепленная генетически способность этого вида — выгодная утилизация углерода и азота.
Сейчас ученые пытаются провести Aureococcus anophagefferens анализ РНК. «Очень важно выяснить то, как происходит у них транскрипция генов во время периода цветения. Мы надеемся, что это поможет нам полностью решить загадку, – как на генетическом уровне эти водоросли реагируют на изменение в окружающей среде», — говорит один из соавторов исследования доктор Дирман.
Более подробно об успешной адаптации Aureococcus anophagefferens к окружающей среде и победе над конкурентами можно прочитать в статье доктора Гоблера и коллег «Niche of harmful alga Aureococcus anophagefferens revealed through ecogenomics», опубликованной в последнем номере журнала PNAS.
Источник: Infox.ru
Геном человека не сидел зря последние пять тысяч лет. Население росло в геометрической прогрессии, и новые генетические мутации возникали с каждым поколением. И теперь мы обладаем замечательным
Джош Эйки из Университета штата Вашингтон (США) и его коллеги смогли «раскопать» варианты, встречающиеся менее чем в 0,1% случаев — на порядок более «высокое разрешение» по сравнению с другими исследованиями.
Из 1,15 млн вариантов одиночных нуклеотидов, найденных среди более чем 15 тыс. кодирующих белки генов, 73% появилось в последние пять тысяч лет.
В среднем 164 688 вариантов (примерно 14%) потенциально вредны, и 86% из них возникло в тот же период. Это объясняется очень просто: чем активнее плодятся люди, тем больше ошибок.
Исследователи обнаружили, что у евроамериканцев больше потенциально вредных вариантов: возможно, это «память» о первоначальной миграции из Африки. Первые небольшие группы людей, которые покинули Африку, испытали внезапное сокращение генетического разнообразия (эффект, известный как «бутылочное горлышко») в результате уменьшения числа партнёров для спаривания. Несмотря на последовавший за этим сравнительно быстрый рост населения, он до сих пор не успел отсеять потенциально вредные мутации.
В целом результаты свидетельствуют о том, что люди несут сегодня больше вредных мутаций, чем несколько тысяч лет назад. Но это не значит, что мы стали более восприимчивыми к болезням, говорит г-н Эйки. Скорее это говорит о том, что большинство болезней вызывается более чем одним вариантом и что у разных людей заболевания развиваются на основе разных генетических путей и механизмов.
Результаты исследования опубликованы в журнале
Источник: КОМПЬЮЛЕНТА
От малых различий в геномах разных людей исследователи перешли к большим. Они проанализировали более 28 тысяч хромосомных перестроек, нашли слабые места в геноме и связали некоторые перестройки с наследственными болезнями.
Генетики сделали еще один шаг к пониманию того, чем одни люди отличаются от других. До сих пор исследования индивидуальных и популяционных различий в геноме человека были направлены на однонуклеотидный полиморфизм (SNP) – точечные мутации, выражающиеся в замене одного нуклеотида другим. Международная команда ученых из Европейской молекулярно-биологической лаборатории (European Molecular Biology Laboratory (EMBL) в Гейдельберге, Германия, Института Сенгера (Wellcome Trust Sanger Institute) в Кембридже, Великобритания, и других научных организаций впервые составила карту крупных вариаций в человеческой ДНК.
Работа проведена в рамках проекта «1000 геномов». Ее результаты опубликованы в последнем выпуске Nature.
Структурные вариации (SV) в геноме (они же называются хромосомными перестройками) – это фрагменты ДНК, которые могут быть вырезаны (делеции), добавлены (инсерции), повернуты наоборот (инверсии) или многократно повторены (дупликации). До сих пор ученые не владели адекватными методами для их анализа и сравнения на уровне последовательности нуклеотидов. Для этой цели генетики в сотрудничестве с биоинформатиками, математиками и программистами разработали новый метод (state-of-the-art DNA sequencing technologies), основанный на 19 новых программах, каждая из которых в отдельности имеет как преимущества, так и недостатки. Этим методом ученые проанализировали данные по геномам 185 человек и описали 22025 выпадений фрагментов ДНК, 6000 вставок, а также несколько тысяч повторов. Все вариации они нанесли на карту человеческих хромосом.
Сопоставление структурных вариаций генома с индивидуальными чертами человека раскрывает значение этих перестроек. Так ученые приближаются к тому, чтобы найти вариации, отвечающие за рост, вес, черты внешности или предрасположенность к болезням. Исследователи обнаружили, что одни участки генома больше подвержены изменениям, чем другие: «Мы нашли 51 «горячую точку», где определенные структурные вариации, такие как делеции, возникают особенно часто, — говорит Жан Корбель (Jan Korbel), исследователь из EMBL. – Например, шесть находятся в участке, который связывают с наследственным заболеванием мозга – синдромом Миллера-Дикера. Знание точной нуклеотидной последовательности структурных вариаций и их окружения поможет нам найти генетическую причину многих необъясненных патологий. А также понять, почему одни люди доживают до старости здоровыми, а другие страдают от болезней». Так, вариации в числе повторов некоторых фрагментов ДНК ученые связывают с дальтонизмом, с шизофренией, а также с несколькими формами рака.
Цель проекта «1000 геномов» состоит в том, чтобы нарисовать примерную генетическую картину человечества, проанализировав геномы по крайней мере 2500 человек из разных популяций. Задача должна быть решена к 2012 году.
Источник: Infox.ru
Ученые впервые расшифровали полный геном домашней свиньи и показали, что он содержит значительное количество генов, отвечающих за иммунитет и обоняние. Гены же, связанные со способностью ощущать вкус, в нем представлены плохо.
Результаты исследования, выполненного международным коллективом ученых,опубликованы в свежем выпуске журнала Nature.
Авторы работы установили, что длина генома домашней свиньи (Sus scrofa domesticus) составляет примерно 2,6 миллиарда нуклеотидных пар. Он на 40% состоит из повторяющихся участков ДНК и содержит в себе почти 22 тысячи генов. В частности, свинья обладает 39 типами генов, кодирующих интерферон (белок, отвечающий за устойчивость к вирусным инфекциям), что в два раза превышает аналогичный показатель у человека.
Сравнение генетических особенностей свиньи и ее диких сородичей показало, что свиньи были одомашнены около 10 тысяч лет назад, причем в Европе и Азии это произошло независимо. Дело в том, что азиатские и европейские свиньи разошлись около 1 миллиона лет назад и уже недалеки от образования отдельных подвидов. Соответственно, одомашненные потомки из разных концов Евразии также существенно отличаются.
Сам же вид Sus scrofa появился примерно 5,3-3,5 миллионов лет назад в Юго-Восточной Азии и затем расселился по всему континенту. Ледниковый период негативно отразился на этих животных, так что около 20 тысяч лет назад они потеряли большую часть своего генетического разнообразия. «Ранее мы судили об этих событиях лишь по митохондриальной ДНК, но расшифровка полного генома позволила уточнить наши представления», -- пояснил Мартин Гренин, один из авторов исследования.
По словам ученых, отсутствие у свиньи генов, связанных с вкусовым восприятием, проливает свет на причины их одомашнивания. «Возможно, наши предки стали содержать свиней из-за того, что те могли питаться пищей, которую не ели сами люди», -- рассказал Алан Арчибальд, соавтор работы. Исследователи надеются, что расшифровка генома свиньи поможет работе селекционеров и тех ученых, которые используют свиней при испытании медицинских препаратов.
Источник: infox.ru
14-09-2012 Просмотров:10087 Новости Зоологии Антоненко Андрей
Самцы косаток — настоящие «маменькины сынки», которые, даже повзрослев, не могут прожить без материнского присмотра. Поэтому косатки, уже выйдя из репродуктивного возраста, продолжают ещё долго опекать своих нежных сыновей. Самки косаток...
29-09-2014 Просмотров:7222 Новости Экологии Антоненко Андрей
Восточная часть южной акватории Аральского моря, относящаяся к территории Узбекистана, впервые полностью высохла за последние 600 лет, свидетельствуют данные Национального управления США по воздухоплаванию и исследованию космического пространства (НАСА), обнародованные в понедельник. Корабли Аральского моряУказанная часть...
06-03-2014 Просмотров:7641 Новости Генетики Антоненко Андрей
Мимикрия сослужила эволюционной биологии хорошую службу, став одним из аргументов в пользу эволюционной теории. Один из двух отцов теории эволюции, Альфред Уоллес, путешествуя по Азии, заметил, что бабочки-парусники Papilio polytes имитируют окраску ядовитой...
21-07-2017 Просмотров:4068 Новости Зоологии Антоненко Андрей
Когнитивные биологи из Лундского университета (Швеция), под руководством Матиаса Освата (Mathias Osvath) выяснили, что во́роны тоже умеют составлять планы на будущее — подобно людям и человекообразным обезьянам. Причем по уровню...
11-10-2013 Просмотров:8186 Новости Геологии Антоненко Андрей
У нашей планеты сложный интерьер, у него много слоёв. Образование и структура этих слоёв — тайна за семью печатями, но время от времени подсказки появляются — благодаря новым исследованиям, конечно,...
Российские и немецкие физики и геологи обнаружили ранее неизвестную прослойку в мантии Земли, в которой содержится гигантское количество жидкого кислорода, экспериментируя с лазерным прессом-"наковальней" в Немецком синхротронном центре DESY, о чем они рассказали в своей статье в журнале Nature Communications. Недра…
Палеонтологи обнаружили в Габоне останки древнейших многоклеточных живых существ, живших в морях примерно 2,1 миллиарда лет назад. Их фотографии опубликованы в журнале PNAS. Окаменелые остатки и следы первых многоклеточных существ"Примерно в…
Смена поведения саранчи зависит не столько от доступности корма, сколько от плотности популяции: высокая плотность в одиночной форме чревата каннибализмом, и, чтобы не съесть друг друга, насекомые переключаются на поведение,…
Европейские палеонтологи описали нового растительноядного динозавра, обладавшего поразительными зубами. Скорее всего, здоровенные самозатачивающиеся зубы, похожие на садовые ножницы, были нужны ему для откусывания листьев и ветвей деревянистых растений. Этой же…
Останки собаки из штата Иллинойс (фото Del Baston / Center for American Archaeology). Споры о том, где и когда произошла доместикация собаки, продолжаются десятилетиями. Самым старым ископаемым образцам, найденным в…
Палеонтологи разглядели на отпечатке древней птицы, жившей 48 млн лет назад, копчиковую железу, а также выявили молекулярные следы жиров для смазки перьев, которые эта железа секретировала. Сохранившаяся копчиковая железа птицы из…
Исследователи представили вещественные доказательства, подтверждающие одну из теорий установления на Земле господства динозавров. Исследование международной команды ученых опубликовано в журнале Science Advances. Теория гибели динозавров знакома многим: 66 миллионов лет назад на Землю упал большой…
Ученые обнаружили на спутнике Юпитера Европе большие запасы перекиси водорода — потенциального источника энергии для бактерий-экстремофилов, которые могут обитать в подледном океане этого небесного тела, сообщает пресс-служба Лаборатории реактивного движения…
Партеногенез или так называемое девственное (или однополое) размножение является одной из форм полового размножения, когда яйцеклетки развиваются во взрослом организме без оплодотворения. Случаи партеногенеза имеют место у многих видов животных,…